Zadaniem Sekretariatu Formacji i Studiów Konferencji jest (SG art. 79/1):
- popieranie dialogu i współpracy w tym, co dotyczy formacji i studiów;
- podtrzymywanie częstych kontaktów z sekretariatem generalnym, a także z sekretarzami prowincjalnym formacji i studiów.
Zadaniem Sekretarza Formacji i Studiów jest (Statuty Sekretariatu, art. 3/1):
- kierowanie i przewodniczenie posiedzeniom Sekretariatu;
- troska o realizację uchwał ogólnozakonnych;
- reprezentowanie Konferencji w spotkaniach międzynarodowych;
- podtrzymywanie kontaktów, dialogu i współpracy sekretarzem generalnym, sekretarzami prowincjalnym i ministrem reprezentującym Konferencję, odpowiedzialnymi za sektor formacji i studiów;
- przekazywanie informacji dotyczących formacji i studiów;
- inspirowanie i koordynowanie dialogu i współpracy w Konferencji, innymi sekretarzami Konferencji Braci Mniejszych oraz innymi rodzinami franciszkańskimi;
- organizowanie kursów formacyjnych dla braci i formatorów.
Środkami, które służą w wypełnianiu zadań sekretariatu i sekretarza są (Statuty Sekretariatu, art. 4):
- osobiste i korespondencyjne kontakty z sekretarzem generalnym, kompetentnym ministrem Konferencji, sekretarzami i sekretariatami formacji i studiów poszczególnych prowincji.
Owocem dialogu i współpracy są następujące inicjatywy Sekretariatu Konferencji:
- rekolekcje dla gwardianów;
- rekolekcje dla formatorów;
- warsztaty formacyjne dla formatorów;
- spotkanie formacyjne braci juniorystów;
- probacja przed ślubami wieczystymi;
- wybrane wspólne wykłady braci kleryków Seminariów Franciszkańskich afiliowanych do UPJPII w Krakowie;
- sympozja organizowane we współpracy z Instytutem Studiów Franciszkańskich w Krakowie;
- piknik franciszkański braci Seminariów Franciszkańskich afiliowanych do UPJPII w Krakowie.